為了保障納稅人的合法權益，國家稅務總局發(fā)布《關于逾期增值稅扣稅憑證抵扣問題的公告》（國稅總[2011]50號），文件明確“對于增值稅一般納稅人發(fā)生真實交易但由于客觀原因造成增值稅扣稅憑證逾期的，經(jīng)主管稅務機關審核、逐級上報，由國家稅務總局認證、稽核比對后，對比對相符的增值稅扣稅憑證，允許納稅人繼續(xù)抵扣其進項稅額。”該公告第一條第三款規(guī)定，上述逾期未抵扣增值稅扣稅憑證針對的是2007年1月1日以后開具的增值稅專用發(fā)票、海關進口增值稅專用繳款書和貨物運輸業(yè)增值稅專用發(fā)票。該企業(yè)滅失發(fā)票屬于增值稅專用發(fā)票，符合該項條款要求。
公告同時強調導致增值稅扣稅憑證逾期抵扣必須屬客觀原因而非企業(yè)主觀所致，且文件列舉了六類情形。此次前來咨詢的企業(yè)滅失扣稅憑證是由臺風災害所致，與文件所列客觀原因相符。
根據(jù)公告所附《逾期增值稅扣稅憑證抵扣管理辦法》，納稅人在申請辦理逾期抵扣時，應報送如下資料：（一）《逾期增值稅扣稅憑證抵扣申請單》；（二）增值稅扣稅憑證逾期情況說明。（三）客觀原因涉及第三方的，應提供第三方證明或說明。（四）逾期增值稅扣稅憑證電子信息；（五）逾期增值稅扣稅憑證復印件。申請逾期抵扣的企業(yè)必須依據(jù)規(guī)定程序逐級遞交資料，不得越級上報，提供的資料應當詳盡完整，交易內容應當真實合理，相關第三方證明或者說明應當邏輯一致、內容相符。該納稅人因自然災害導致扣稅憑證逾期，在提供逾期說明時應當詳細闡述自然災害發(fā)生的時間、地點、對公司生產(chǎn)經(jīng)營造成的實際影響，同時在提供扣稅憑證復印件時，應當在備注欄注明“與原件一致”，加蓋企業(yè)公章，發(fā)票復印件需裁剪成與原發(fā)票大小一致以便認證稽核比對。
經(jīng)主管稅務機關審核，逾期申請逐級遞交至國家稅務總局，由國家稅務總局“對逾期增值稅扣稅憑證信息進行認證、稽核比對，對資料符合條件、稽核比對結果相符的，通知省稅務機關允許納稅人繼續(xù)抵扣逾期增值稅扣稅憑證上所注明或計算的稅額”。主管稅務機關對該項申請保留事后檢查權，若存在虛假偽造情況，一經(jīng)發(fā)現(xiàn)，可責令納稅人將已抵扣的進項稅額即刻轉出，同時根據(jù)《中華人民共和國稅收征收管理法》實施相應的處罰措施。
由于該項申請流程較為復雜，耗時較久，建議納稅人在日常生產(chǎn)管理中做好增值稅扣稅憑證的管理與保管，可定時登錄增值稅發(fā)票查詢平臺查閱未認證發(fā)票記錄或登錄網(wǎng)上申報平臺查看《增值稅專用發(fā)票存根聯(lián)滯留管理系統(tǒng)》推送提醒的企業(yè)超過90天滯留未認證增值稅扣稅憑證信息，防范發(fā)生逾期未抵扣的情況。
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作者：周茜茜
來源：中國稅務報客戶端
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